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单细胞RNA结构测序的新方法揭示了人类发育和疾病的生物标志物

导读 新加坡科技研究局 (A*STAR) 基因组研究所 (GIS) 的研究人员发现了一种创新的单细胞核糖核酸 (RNA) 测序方法,以研究 RNA 结构在单...

新加坡科技研究局 (A*STAR) 基因组研究所 (GIS) 的研究人员发现了一种创新的单细胞核糖核酸 (RNA) 测序方法,以研究 RNA 结构在单个细胞中的作用。由于单个细胞中的 RNA 形状可能有所不同并驱动不同的功能,因此研究许多细胞中的集体 RNA 形状可能会忽略 RNA 结构和功能的个体变异性。

这种新方法被命名为 Sc-SPORT for Single Cell Structure Probing Of RNA Transcripts,能够根据形状而不是序列来识别对人类发育和疾病至关重要的生物标志物。虽然单细胞基因表达分析显示了看似相似的单个细胞中存在的多样性程度,但尚不清楚其他元素是否也会影响细胞命运。通过这种方法,研究人员现在可以使用 RNA 结构作为额外的信息水平来识别发育和疾病中的细胞类型。

论文“单细胞分辨率的 RNA 结构分析揭示了细胞身份的新决定因素”发表在《自然方法》杂志上。

在过去的十年中,通过各种单细胞测序技术了解单个细胞的不同成分已经取得了突飞猛进的进步。随着研究人员深入研究单个细胞的各层,预测细胞轨迹变得越来越准确。

该研究由 A*STAR GIS 副执行主任兼首席研究员 Wan Yue 博士和 A*STAR GIS 研究员王家旭博士领导,与 A*STAR 生物信息学研究所 (BII) 首席研究员 Roland Huber 博士合作,这项研究标志着首次在单细胞水平上探索 RNA 结构,特别针对稀有细胞类型和 RNA 结构异质性。过去,在大量研究RNA结构时,研究人员需要从数百万个细胞开始。